La storia di Aeterna Noctis ci racconta l’eterno conflitto tra il Re delle Tenebre e la Regina della Luce, nati entrambi dal caos, e chiamati al continuo conflitto per mantenere l’equilibrio della vita stessa. Difatti queste due entità si danno battaglia sin dall’inizio dei tempi, fino a quando una delle due non viene sconfitta. Quando ciò accade, lo sconfitto deve intraprendere un lungo viaggio per ritrovare tutti i suoi poteri, in modo da sfidare nuovamente l’altro, sperando di riuscire ad avere la meglio e dare inizio a un nuovo ciclo. Così per l’eternità, così fino a quando esisterà la vita.
Anche se la storia rappresenta uno degli stereotipi più utilizzati in libri, film, videogiochi e quant’altro,